Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCB11O95342 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCB11O95342 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCB11O95342 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCB11O95342 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCB11O95342 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCB11O95342 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCB11O95342 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCB11O95342 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCB11O95342 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCB11O95342 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCB11O95342 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCB11O95342 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCB11O95342 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCB11O95342 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCB11O95342 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms