Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FLOT1O75955 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FLOT1O75955 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms