Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSDE1O75534 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CSDE1O75534 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms