Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGR5O75473 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGR5O75473 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGR5O75473 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGR5O75473 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LGR5O75473 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGR5O75473 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGR5O75473 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGR5O75473 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LGR5O75473 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGR5O75473 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGR5O75473 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGR5O75473 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGR5O75473 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGR5O75473 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGR5O75473 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LGR5O75473 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGR5O75473 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGR5O75473 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGR5O75473 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGR5O75473 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGR5O75473 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGR5O75473 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGR5O75473 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGR5O75473 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGR5O75473 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGR5O75473 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGR5O75473 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LGR5O75473 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LGR5O75473 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LGR5O75473 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LGR5O75473 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LGR5O75473 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LGR5O75473 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LGR5O75473 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LGR5O75473 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LGR5O75473 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LGR5O75473 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LGR5O75473 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LGR5O75473 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LGR5O75473 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LGR5O75473 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LGR5O75473 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LGR5O75473 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LGR5O75473 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LGR5O75473 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LGR5O75473 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LGR5O75473 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LGR5O75473 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LGR5O75473 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LGR5O75473 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LGR5O75473 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LGR5O75473 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LGR5O75473 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LGR5O75473 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LGR5O75473 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGR5O75473 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGR5O75473 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGR5O75473 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LGR5O75473 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGR5O75473 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LGR5O75473 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGR5O75473 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGR5O75473 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LGR5O75473 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGR5O75473 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGR5O75473 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGR5O75473 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGR5O75473 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGR5O75473 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGR5O75473 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGR5O75473 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LGR5O75473 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGR5O75473 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGR5O75473 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGR5O75473 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGR5O75473 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGR5O75473 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGR5O75473 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGR5O75473 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGR5O75473 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGR5O75473 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGR5O75473 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGR5O75473 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGR5O75473 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGR5O75473 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGR5O75473 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGR5O75473 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGR5O75473 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGR5O75473 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGR5O75473 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGR5O75473 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGR5O75473 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGR5O75473 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LGR5O75473 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGR5O75473 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGR5O75473 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGR5O75473 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGR5O75473 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGR5O75473 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms