Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F6O75461 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F6O75461 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F6O75461 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F6O75461 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F6O75461 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F6O75461 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F6O75461 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F6O75461 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F6O75461 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F6O75461 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F6O75461 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F6O75461 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2F6O75461 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F6O75461 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F6O75461 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F6O75461 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F6O75461 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F6O75461 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F6O75461 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F6O75461 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F6O75461 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F6O75461 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F6O75461 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F6O75461 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F6O75461 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F6O75461 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F6O75461 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F6O75461 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F6O75461 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F6O75461 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2F6O75461 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F6O75461 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F6O75461 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F6O75461 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F6O75461 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F6O75461 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F6O75461 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F6O75461 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F6O75461 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F6O75461 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F6O75461 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F6O75461 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F6O75461 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F6O75461 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F6O75461 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F6O75461 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F6O75461 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F6O75461 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F6O75461 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F6O75461 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F6O75461 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F6O75461 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F6O75461 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F6O75461 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F6O75461 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F6O75461 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F6O75461 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F6O75461 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F6O75461 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F6O75461 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F6O75461 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F6O75461 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F6O75461 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F6O75461 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F6O75461 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F6O75461 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F6O75461 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F6O75461 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F6O75461 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F6O75461 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F6O75461 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F6O75461 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F6O75461 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F6O75461 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F6O75461 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F6O75461 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F6O75461 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F6O75461 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F6O75461 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F6O75461 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F6O75461 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F6O75461 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F6O75461 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F6O75461 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F6O75461 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F6O75461 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F6O75461 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F6O75461 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F6O75461 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F6O75461 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F6O75461 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F6O75461 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F6O75461 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F6O75461 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F6O75461 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F6O75461 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F6O75461 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F6O75461 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F6O75461 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms