Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRCH4O75427 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH4O75427 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms