Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX3O75364 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX3O75364 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX3O75364 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX3O75364 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX3O75364 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX3O75364 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX3O75364 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX3O75364 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX3O75364 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX3O75364 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX3O75364 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX3O75364 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX3O75364 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX3O75364 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX3O75364 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX3O75364 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX3O75364 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX3O75364 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX3O75364 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX3O75364 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX3O75364 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX3O75364 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX3O75364 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX3O75364 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX3O75364 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITX3O75364 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX3O75364 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX3O75364 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX3O75364 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX3O75364 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX3O75364 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX3O75364 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX3O75364 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX3O75364 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX3O75364 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX3O75364 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX3O75364 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX3O75364 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX3O75364 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX3O75364 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX3O75364 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX3O75364 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX3O75364 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX3O75364 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX3O75364 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX3O75364 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX3O75364 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX3O75364 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX3O75364 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PITX3O75364 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX3O75364 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX3O75364 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX3O75364 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX3O75364 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX3O75364 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX3O75364 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX3O75364 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX3O75364 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX3O75364 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX3O75364 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX3O75364 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX3O75364 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX3O75364 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX3O75364 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX3O75364 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX3O75364 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX3O75364 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX3O75364 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX3O75364 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX3O75364 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX3O75364 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PITX3O75364 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX3O75364 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX3O75364 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX3O75364 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX3O75364 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX3O75364 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX3O75364 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX3O75364 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX3O75364 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX3O75364 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX3O75364 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX3O75364 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PITX3O75364 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PITX3O75364 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PITX3O75364 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PITX3O75364 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PITX3O75364 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PITX3O75364 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PITX3O75364 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX3O75364 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX3O75364 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX3O75364 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX3O75364 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX3O75364 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX3O75364 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX3O75364 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX3O75364 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PITX3O75364 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms