Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF40O75150 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF40O75150 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF40O75150 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF40O75150 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF40O75150 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF40O75150 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF40O75150 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF40O75150 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF40O75150 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF40O75150 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF40O75150 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF40O75150 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF40O75150 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF40O75150 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF40O75150 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF40O75150 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF40O75150 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF40O75150 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF40O75150 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF40O75150 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF40O75150 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF40O75150 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF40O75150 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF40O75150 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF40O75150 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF40O75150 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF40O75150 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF40O75150 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF40O75150 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF40O75150 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF40O75150 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF40O75150 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF40O75150 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF40O75150 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF40O75150 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF40O75150 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF40O75150 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF40O75150 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF40O75150 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF40O75150 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF40O75150 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF40O75150 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF40O75150 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF40O75150 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF40O75150 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF40O75150 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF40O75150 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF40O75150 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF40O75150 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF40O75150 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF40O75150 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF40O75150 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF40O75150 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF40O75150 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF40O75150 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF40O75150 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF40O75150 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF40O75150 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF40O75150 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF40O75150 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF40O75150 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF40O75150 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF40O75150 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF40O75150 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF40O75150 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF40O75150 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF40O75150 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF40O75150 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF40O75150 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF40O75150 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF40O75150 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF40O75150 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF40O75150 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF40O75150 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF40O75150 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF40O75150 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF40O75150 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF40O75150 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF40O75150 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF40O75150 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF40O75150 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF40O75150 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF40O75150 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF40O75150 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF40O75150 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF40O75150 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF40O75150 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF40O75150 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF40O75150 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF40O75150 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF40O75150 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF40O75150 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF40O75150 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF40O75150 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF40O75150 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF40O75150 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF40O75150 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF40O75150 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF40O75150 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms