Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NBNO60934 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBNO60934 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBNO60934 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBNO60934 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBNO60934 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBNO60934 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBNO60934 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBNO60934 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBNO60934 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBNO60934 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBNO60934 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBNO60934 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBNO60934 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBNO60934 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBNO60934 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NBNO60934 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NBNO60934 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NBNO60934 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NBNO60934 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NBNO60934 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NBNO60934 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NBNO60934 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NBNO60934 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NBNO60934 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NBNO60934 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NBNO60934 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NBNO60934 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NBNO60934 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NBNO60934 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NBNO60934 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NBNO60934 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NBNO60934 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NBNO60934 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NBNO60934 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NBNO60934 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NBNO60934 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NBNO60934 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NBNO60934 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NBNO60934 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NBNO60934 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NBNO60934 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NBNO60934 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NBNO60934 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NBNO60934 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NBNO60934 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NBNO60934 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NBNO60934 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NBNO60934 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NBNO60934 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NBNO60934 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NBNO60934 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NBNO60934 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBNO60934 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBNO60934 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBNO60934 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NBNO60934 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NBNO60934 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBNO60934 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NBNO60934 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NBNO60934 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBNO60934 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBNO60934 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBNO60934 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NBNO60934 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBNO60934 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBNO60934 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBNO60934 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBNO60934 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBNO60934 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBNO60934 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBNO60934 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBNO60934 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBNO60934 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBNO60934 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBNO60934 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBNO60934 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBNO60934 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBNO60934 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBNO60934 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBNO60934 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBNO60934 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBNO60934 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBNO60934 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBNO60934 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBNO60934 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBNO60934 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBNO60934 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBNO60934 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NBNO60934 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NBNO60934 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBNO60934 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBNO60934 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NBNO60934 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NBNO60934 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NBNO60934 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBNO60934 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBNO60934 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBNO60934 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NBNO60934 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms