Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSCO60682 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSCO60682 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSCO60682 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSCO60682 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSCO60682 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSCO60682 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSCO60682 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSCO60682 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSCO60682 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSCO60682 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSCO60682 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MSCO60682 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MSCO60682 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSCO60682 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSCO60682 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSCO60682 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSCO60682 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSCO60682 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSCO60682 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSCO60682 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSCO60682 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSCO60682 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MSCO60682 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MSCO60682 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MSCO60682 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MSCO60682 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MSCO60682 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MSCO60682 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MSCO60682 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSCO60682 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSCO60682 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSCO60682 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSCO60682 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSCO60682 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MSCO60682 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MSCO60682 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MSCO60682 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MSCO60682 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSCO60682 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSCO60682 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSCO60682 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSCO60682 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSCO60682 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSCO60682 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSCO60682 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSCO60682 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSCO60682 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSCO60682 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSCO60682 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSCO60682 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MSCO60682 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MSCO60682 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSCO60682 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSCO60682 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSCO60682 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSCO60682 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSCO60682 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MSCO60682 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSCO60682 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSCO60682 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSCO60682 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSCO60682 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MSCO60682 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSCO60682 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSCO60682 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSCO60682 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSCO60682 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSCO60682 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSCO60682 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MSCO60682 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSCO60682 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSCO60682 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSCO60682 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSCO60682 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSCO60682 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSCO60682 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSCO60682 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSCO60682 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSCO60682 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSCO60682 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSCO60682 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSCO60682 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSCO60682 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSCO60682 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSCO60682 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSCO60682 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSCO60682 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSCO60682 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSCO60682 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSCO60682 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSCO60682 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSCO60682 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MSCO60682 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MSCO60682 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MSCO60682 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MSCO60682 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MSCO60682 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MSCO60682 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MSCO60682 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms