Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PPLO60437 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PPLO60437 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PPLO60437 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PPLO60437 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PPLO60437 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PPLO60437 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PPLO60437 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PPLO60437 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PPLO60437 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PPLO60437 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PPLO60437 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PPLO60437 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PPLO60437 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PPLO60437 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PPLO60437 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PPLO60437 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PPLO60437 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PPLO60437 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PPLO60437 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PPLO60437 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PPLO60437 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PPLO60437 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PPLO60437 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PPLO60437 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PPLO60437 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
PPLO60437 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PPLO60437 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PPLO60437 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PPLO60437 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PPLO60437 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PPLO60437 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PPLO60437 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PPLO60437 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PPLO60437 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PPLO60437 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PPLO60437 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PPLO60437 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PPLO60437 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PPLO60437 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PPLO60437 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
PPLO60437 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
PPLO60437 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PPLO60437 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PPLO60437 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PPLO60437 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PPLO60437 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PPLO60437 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PPLO60437 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PPLO60437 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PPLO60437 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PPLO60437 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PPLO60437 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PPLO60437 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PPLO60437 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PPLO60437 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PPLO60437 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PPLO60437 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
PPLO60437 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PPLO60437 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
PPLO60437 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PPLO60437 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PPLO60437 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PPLO60437 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PPLO60437 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PPLO60437 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PPLO60437 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PPLO60437 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PPLO60437 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PPLO60437 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PPLO60437 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PPLO60437 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PPLO60437 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PPLO60437 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PPLO60437 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PPLO60437 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PPLO60437 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PPLO60437 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PPLO60437 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PPLO60437 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
PPLO60437 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PPLO60437 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PPLO60437 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PPLO60437 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PPLO60437 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PPLO60437 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
PPLO60437 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PPLO60437 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PPLO60437 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PPLO60437 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PPLO60437 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PPLO60437 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PPLO60437 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
PPLO60437 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
PPLO60437 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PPLO60437 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PPLO60437 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
PPLO60437 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PPLO60437 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PPLO60437 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms