Protein–RNA interactions for Protein: O60318

MCM3AP, Germinal-center associated nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3APO60318 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCM3APO60318 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM3APO60318 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM3APO60318 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM3APO60318 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM3APO60318 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM3APO60318 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM3APO60318 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM3APO60318 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM3APO60318 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCM3APO60318 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM3APO60318 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM3APO60318 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM3APO60318 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM3APO60318 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM3APO60318 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM3APO60318 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM3APO60318 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM3APO60318 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM3APO60318 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM3APO60318 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCM3APO60318 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM3APO60318 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM3APO60318 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM3APO60318 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM3APO60318 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM3APO60318 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCM3APO60318 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms