Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC34.52■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
KIAA0556O60303 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC34.51■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC34.47■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
KIAA0556O60303 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms