Protein–RNA interactions for Protein: O60260

PRKN, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKNO60260 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKNO60260 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKNO60260 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKNO60260 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKNO60260 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKNO60260 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKNO60260 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKNO60260 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKNO60260 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKNO60260 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKNO60260 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKNO60260 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKNO60260 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKNO60260 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKNO60260 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKNO60260 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKNO60260 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKNO60260 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKNO60260 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKNO60260 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKNO60260 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKNO60260 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKNO60260 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKNO60260 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKNO60260 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKNO60260 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKNO60260 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKNO60260 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKNO60260 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKNO60260 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKNO60260 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKNO60260 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKNO60260 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKNO60260 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKNO60260 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKNO60260 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKNO60260 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKNO60260 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKNO60260 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKNO60260 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKNO60260 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKNO60260 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKNO60260 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKNO60260 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKNO60260 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKNO60260 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKNO60260 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKNO60260 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKNO60260 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKNO60260 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKNO60260 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKNO60260 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKNO60260 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKNO60260 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKNO60260 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKNO60260 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKNO60260 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKNO60260 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKNO60260 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKNO60260 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKNO60260 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKNO60260 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKNO60260 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKNO60260 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKNO60260 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKNO60260 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKNO60260 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKNO60260 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKNO60260 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKNO60260 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKNO60260 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKNO60260 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKNO60260 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKNO60260 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKNO60260 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKNO60260 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKNO60260 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKNO60260 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKNO60260 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKNO60260 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKNO60260 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKNO60260 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKNO60260 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKNO60260 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKNO60260 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKNO60260 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKNO60260 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKNO60260 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKNO60260 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKNO60260 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKNO60260 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKNO60260 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKNO60260 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKNO60260 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKNO60260 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKNO60260 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKNO60260 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKNO60260 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKNO60260 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKNO60260 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms