Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP9BO43861 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP9BO43861 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms