Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDIL3O43854 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDIL3O43854 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDIL3O43854 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDIL3O43854 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDIL3O43854 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDIL3O43854 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDIL3O43854 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EDIL3O43854 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDIL3O43854 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDIL3O43854 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDIL3O43854 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDIL3O43854 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDIL3O43854 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EDIL3O43854 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDIL3O43854 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDIL3O43854 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDIL3O43854 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDIL3O43854 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDIL3O43854 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDIL3O43854 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDIL3O43854 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EDIL3O43854 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDIL3O43854 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EDIL3O43854 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EDIL3O43854 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms