Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRPF3O43395 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF3O43395 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms