Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATMINO43313 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATMINO43313 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATMINO43313 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATMINO43313 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATMINO43313 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATMINO43313 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATMINO43313 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATMINO43313 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATMINO43313 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATMINO43313 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATMINO43313 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATMINO43313 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATMINO43313 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATMINO43313 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATMINO43313 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATMINO43313 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATMINO43313 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATMINO43313 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATMINO43313 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATMINO43313 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATMINO43313 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATMINO43313 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATMINO43313 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATMINO43313 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATMINO43313 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATMINO43313 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATMINO43313 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATMINO43313 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATMINO43313 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATMINO43313 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATMINO43313 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATMINO43313 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATMINO43313 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATMINO43313 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATMINO43313 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATMINO43313 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATMINO43313 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATMINO43313 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATMINO43313 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATMINO43313 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATMINO43313 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATMINO43313 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATMINO43313 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATMINO43313 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATMINO43313 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATMINO43313 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATMINO43313 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATMINO43313 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATMINO43313 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATMINO43313 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATMINO43313 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATMINO43313 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATMINO43313 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATMINO43313 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATMINO43313 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATMINO43313 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATMINO43313 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATMINO43313 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATMINO43313 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATMINO43313 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATMINO43313 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATMINO43313 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATMINO43313 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATMINO43313 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATMINO43313 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATMINO43313 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATMINO43313 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATMINO43313 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATMINO43313 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATMINO43313 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATMINO43313 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATMINO43313 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATMINO43313 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATMINO43313 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATMINO43313 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATMINO43313 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATMINO43313 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATMINO43313 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATMINO43313 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATMINO43313 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATMINO43313 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATMINO43313 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATMINO43313 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATMINO43313 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATMINO43313 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATMINO43313 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATMINO43313 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATMINO43313 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATMINO43313 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATMINO43313 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATMINO43313 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATMINO43313 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATMINO43313 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATMINO43313 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATMINO43313 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATMINO43313 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATMINO43313 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATMINO43313 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATMINO43313 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms