Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRGAP3O43295 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRGAP3O43295 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRGAP3O43295 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms