Protein–RNA interactions for Protein: O15439

ABCC4, Multidrug resistance-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC4O15439 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC4O15439 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC4O15439 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms