Protein–RNA interactions for Protein: O14994

SYN3, Synapsin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3O14994 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYN3O14994 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYN3O14994 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYN3O14994 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYN3O14994 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYN3O14994 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYN3O14994 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYN3O14994 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYN3O14994 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYN3O14994 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYN3O14994 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYN3O14994 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYN3O14994 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYN3O14994 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYN3O14994 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYN3O14994 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYN3O14994 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYN3O14994 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYN3O14994 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYN3O14994 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYN3O14994 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SYN3O14994 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYN3O14994 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYN3O14994 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SYN3O14994 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYN3O14994 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYN3O14994 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYN3O14994 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYN3O14994 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYN3O14994 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYN3O14994 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYN3O14994 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYN3O14994 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYN3O14994 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYN3O14994 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYN3O14994 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYN3O14994 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYN3O14994 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYN3O14994 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYN3O14994 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYN3O14994 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYN3O14994 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYN3O14994 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYN3O14994 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYN3O14994 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYN3O14994 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYN3O14994 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYN3O14994 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYN3O14994 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYN3O14994 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYN3O14994 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYN3O14994 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYN3O14994 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SYN3O14994 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYN3O14994 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SYN3O14994 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SYN3O14994 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYN3O14994 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYN3O14994 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYN3O14994 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYN3O14994 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SYN3O14994 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYN3O14994 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYN3O14994 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYN3O14994 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYN3O14994 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYN3O14994 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYN3O14994 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYN3O14994 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYN3O14994 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYN3O14994 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYN3O14994 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYN3O14994 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYN3O14994 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYN3O14994 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYN3O14994 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYN3O14994 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYN3O14994 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYN3O14994 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYN3O14994 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYN3O14994 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYN3O14994 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYN3O14994 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYN3O14994 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYN3O14994 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYN3O14994 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYN3O14994 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYN3O14994 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYN3O14994 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYN3O14994 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SYN3O14994 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYN3O14994 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYN3O14994 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYN3O14994 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYN3O14994 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYN3O14994 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYN3O14994 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYN3O14994 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYN3O14994 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYN3O14994 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
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