Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PHOX2AO14813 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PHOX2AO14813 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms