Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDC80O14777 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDC80O14777 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDC80O14777 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NDC80O14777 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDC80O14777 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDC80O14777 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDC80O14777 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDC80O14777 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDC80O14777 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDC80O14777 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDC80O14777 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDC80O14777 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDC80O14777 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDC80O14777 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDC80O14777 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDC80O14777 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDC80O14777 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDC80O14777 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NDC80O14777 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDC80O14777 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDC80O14777 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDC80O14777 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDC80O14777 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDC80O14777 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDC80O14777 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDC80O14777 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDC80O14777 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDC80O14777 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDC80O14777 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDC80O14777 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NDC80O14777 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NDC80O14777 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDC80O14777 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDC80O14777 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDC80O14777 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDC80O14777 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDC80O14777 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDC80O14777 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDC80O14777 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDC80O14777 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDC80O14777 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDC80O14777 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDC80O14777 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDC80O14777 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDC80O14777 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NDC80O14777 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NDC80O14777 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NDC80O14777 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDC80O14777 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDC80O14777 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDC80O14777 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDC80O14777 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDC80O14777 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDC80O14777 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDC80O14777 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDC80O14777 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDC80O14777 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDC80O14777 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDC80O14777 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDC80O14777 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDC80O14777 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDC80O14777 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDC80O14777 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDC80O14777 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDC80O14777 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDC80O14777 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDC80O14777 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDC80O14777 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDC80O14777 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDC80O14777 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDC80O14777 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDC80O14777 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDC80O14777 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDC80O14777 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDC80O14777 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDC80O14777 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDC80O14777 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDC80O14777 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDC80O14777 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDC80O14777 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDC80O14777 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDC80O14777 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDC80O14777 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDC80O14777 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDC80O14777 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDC80O14777 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDC80O14777 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDC80O14777 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDC80O14777 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDC80O14777 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NDC80O14777 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDC80O14777 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDC80O14777 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDC80O14777 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDC80O14777 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDC80O14777 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDC80O14777 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NDC80O14777 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDC80O14777 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms