Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSP2O14595 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSP2O14595 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTDSP2O14595 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSP2O14595 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSP2O14595 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSP2O14595 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSP2O14595 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSP2O14595 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSP2O14595 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSP2O14595 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSP2O14595 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSP2O14595 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSP2O14595 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSP2O14595 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSP2O14595 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSP2O14595 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSP2O14595 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CTDSP2O14595 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTDSP2O14595 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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