Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F3O00716 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F3O00716 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F3O00716 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F3O00716 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F3O00716 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F3O00716 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F3O00716 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F3O00716 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F3O00716 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F3O00716 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F3O00716 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F3O00716 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F3O00716 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F3O00716 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F3O00716 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F3O00716 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F3O00716 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
E2F3O00716 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F3O00716 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F3O00716 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F3O00716 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F3O00716 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
E2F3O00716 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
E2F3O00716 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
E2F3O00716 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E2F3O00716 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
E2F3O00716 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F3O00716 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F3O00716 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F3O00716 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F3O00716 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F3O00716 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F3O00716 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F3O00716 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F3O00716 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
E2F3O00716 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F3O00716 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F3O00716 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F3O00716 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F3O00716 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F3O00716 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F3O00716 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F3O00716 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F3O00716 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F3O00716 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F3O00716 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F3O00716 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F3O00716 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F3O00716 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F3O00716 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
E2F3O00716 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F3O00716 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F3O00716 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F3O00716 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F3O00716 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F3O00716 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F3O00716 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F3O00716 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F3O00716 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F3O00716 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F3O00716 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F3O00716 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F3O00716 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F3O00716 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F3O00716 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
E2F3O00716 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F3O00716 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F3O00716 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F3O00716 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F3O00716 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F3O00716 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F3O00716 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F3O00716 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F3O00716 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F3O00716 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F3O00716 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F3O00716 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F3O00716 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F3O00716 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F3O00716 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
E2F3O00716 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F3O00716 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F3O00716 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F3O00716 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F3O00716 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F3O00716 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F3O00716 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F3O00716 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F3O00716 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F3O00716 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F3O00716 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F3O00716 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F3O00716 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F3O00716 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F3O00716 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F3O00716 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F3O00716 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
E2F3O00716 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
E2F3O00716 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms