Protein–RNA interactions for Protein: O00628

PEX7, Peroxisomal targeting signal 2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX7O00628 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX7O00628 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX7O00628 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX7O00628 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX7O00628 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX7O00628 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX7O00628 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX7O00628 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX7O00628 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX7O00628 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX7O00628 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PEX7O00628 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX7O00628 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX7O00628 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX7O00628 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX7O00628 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX7O00628 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX7O00628 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX7O00628 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX7O00628 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX7O00628 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX7O00628 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX7O00628 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX7O00628 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX7O00628 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX7O00628 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX7O00628 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX7O00628 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX7O00628 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX7O00628 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX7O00628 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PEX7O00628 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX7O00628 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX7O00628 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX7O00628 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX7O00628 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX7O00628 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX7O00628 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX7O00628 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX7O00628 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX7O00628 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX7O00628 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX7O00628 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX7O00628 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX7O00628 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX7O00628 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PEX7O00628 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX7O00628 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX7O00628 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX7O00628 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX7O00628 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX7O00628 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX7O00628 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX7O00628 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX7O00628 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX7O00628 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX7O00628 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX7O00628 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX7O00628 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX7O00628 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX7O00628 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX7O00628 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX7O00628 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX7O00628 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX7O00628 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PEX7O00628 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX7O00628 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX7O00628 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX7O00628 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX7O00628 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX7O00628 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX7O00628 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX7O00628 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX7O00628 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX7O00628 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX7O00628 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX7O00628 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX7O00628 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX7O00628 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX7O00628 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX7O00628 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX7O00628 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX7O00628 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX7O00628 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX7O00628 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX7O00628 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX7O00628 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX7O00628 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX7O00628 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX7O00628 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX7O00628 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX7O00628 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PEX7O00628 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX7O00628 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX7O00628 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX7O00628 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX7O00628 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX7O00628 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX7O00628 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PEX7O00628 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms