Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIK3CDO00329 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3CDO00329 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms