Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIP1O00291 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIP1O00291 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIP1O00291 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIP1O00291 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIP1O00291 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIP1O00291 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIP1O00291 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIP1O00291 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIP1O00291 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIP1O00291 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HIP1O00291 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIP1O00291 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIP1O00291 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HIP1O00291 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HIP1O00291 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIP1O00291 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIP1O00291 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HIP1O00291 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HIP1O00291 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIP1O00291 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HIP1O00291 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIP1O00291 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIP1O00291 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIP1O00291 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIP1O00291 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIP1O00291 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIP1O00291 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIP1O00291 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIP1O00291 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HIP1O00291 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
HIP1O00291 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIP1O00291 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIP1O00291 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIP1O00291 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIP1O00291 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIP1O00291 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIP1O00291 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIP1O00291 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIP1O00291 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIP1O00291 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIP1O00291 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIP1O00291 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIP1O00291 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIP1O00291 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIP1O00291 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HIP1O00291 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIP1O00291 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIP1O00291 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIP1O00291 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIP1O00291 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIP1O00291 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIP1O00291 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIP1O00291 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIP1O00291 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIP1O00291 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIP1O00291 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIP1O00291 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIP1O00291 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIP1O00291 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HIP1O00291 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIP1O00291 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIP1O00291 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIP1O00291 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIP1O00291 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIP1O00291 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIP1O00291 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIP1O00291 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIP1O00291 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HIP1O00291 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIP1O00291 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIP1O00291 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIP1O00291 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIP1O00291 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIP1O00291 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIP1O00291 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIP1O00291 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HIP1O00291 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIP1O00291 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIP1O00291 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIP1O00291 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIP1O00291 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIP1O00291 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIP1O00291 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIP1O00291 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HIP1O00291 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HIP1O00291 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIP1O00291 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIP1O00291 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIP1O00291 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIP1O00291 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIP1O00291 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIP1O00291 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIP1O00291 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HIP1O00291 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIP1O00291 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIP1O00291 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIP1O00291 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIP1O00291 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIP1O00291 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms