Protein–RNA interactions for Protein: O00237

RNF103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF103O00237 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF103O00237 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF103O00237 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF103O00237 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF103O00237 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF103O00237 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF103O00237 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF103O00237 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF103O00237 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF103O00237 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF103O00237 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF103O00237 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF103O00237 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF103O00237 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF103O00237 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF103O00237 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF103O00237 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF103O00237 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF103O00237 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF103O00237 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF103O00237 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF103O00237 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF103O00237 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF103O00237 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF103O00237 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF103O00237 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF103O00237 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF103O00237 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF103O00237 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF103O00237 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF103O00237 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF103O00237 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF103O00237 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF103O00237 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF103O00237 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF103O00237 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF103O00237 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF103O00237 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF103O00237 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF103O00237 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF103O00237 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF103O00237 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF103O00237 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF103O00237 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF103O00237 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF103O00237 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF103O00237 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF103O00237 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF103O00237 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF103O00237 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF103O00237 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF103O00237 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF103O00237 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF103O00237 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF103O00237 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF103O00237 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF103O00237 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF103O00237 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF103O00237 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF103O00237 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF103O00237 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF103O00237 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF103O00237 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF103O00237 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF103O00237 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF103O00237 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF103O00237 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF103O00237 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF103O00237 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF103O00237 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF103O00237 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF103O00237 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF103O00237 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF103O00237 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF103O00237 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF103O00237 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF103O00237 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF103O00237 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF103O00237 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF103O00237 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF103O00237 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF103O00237 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF103O00237 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF103O00237 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF103O00237 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF103O00237 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF103O00237 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF103O00237 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF103O00237 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF103O00237 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF103O00237 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF103O00237 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF103O00237 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF103O00237 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF103O00237 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF103O00237 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF103O00237 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF103O00237 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF103O00237 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF103O00237 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms