Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOC4-APOC2K7ER74 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOC4-APOC2K7ER74 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms