Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA8SH3BPF8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GOLGA8SH3BPF8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms