Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SRRM5B3KS81 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms