Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL13PA6NNM8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL13PA6NNM8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL13PA6NNM8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL13PA6NNM8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL13PA6NNM8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL13PA6NNM8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL13PA6NNM8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL13PA6NNM8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL13PA6NNM8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL13PA6NNM8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL13PA6NNM8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL13PA6NNM8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTLL13PA6NNM8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL13PA6NNM8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL13PA6NNM8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL13PA6NNM8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL13PA6NNM8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL13PA6NNM8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL13PA6NNM8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL13PA6NNM8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL13PA6NNM8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL13PA6NNM8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL13PA6NNM8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL13PA6NNM8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL13PA6NNM8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL13PA6NNM8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTLL13PA6NNM8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTLL13PA6NNM8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTLL13PA6NNM8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTLL13PA6NNM8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTLL13PA6NNM8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTLL13PA6NNM8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TTLL13PA6NNM8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TTLL13PA6NNM8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTLL13PA6NNM8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms