Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF233A6NK53 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF233A6NK53 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF233A6NK53 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF233A6NK53 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF233A6NK53 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF233A6NK53 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF233A6NK53 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF233A6NK53 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF233A6NK53 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF233A6NK53 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF233A6NK53 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF233A6NK53 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF233A6NK53 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF233A6NK53 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF233A6NK53 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms