Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CBY3A6NI87 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBY3A6NI87 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBY3A6NI87 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBY3A6NI87 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBY3A6NI87 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBY3A6NI87 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CBY3A6NI87 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms