Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC69A6NI79 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms