Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LCHNA4D1U4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LCHNA4D1U4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCHNA4D1U4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCHNA4D1U4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCHNA4D1U4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCHNA4D1U4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCHNA4D1U4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LCHNA4D1U4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCHNA4D1U4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LCHNA4D1U4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms