Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ7

PRAMEF27, PRAME family member 27, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF27A3QJZ7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF27A3QJZ7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRAMEF27A3QJZ7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms