Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PRAMEF22A3QJZ6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRAMEF22A3QJZ6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRAMEF22A3QJZ6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms