Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCC8

Tomm20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20Q9DCC8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tomm20Q9DCC8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tomm20Q9DCC8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tomm20Q9DCC8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tomm20Q9DCC8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tomm20Q9DCC8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tomm20Q9DCC8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tomm20Q9DCC8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tomm20Q9DCC8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tomm20Q9DCC8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tomm20Q9DCC8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tomm20Q9DCC8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tomm20Q9DCC8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tomm20Q9DCC8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tomm20Q9DCC8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tomm20Q9DCC8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tomm20Q9DCC8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tomm20Q9DCC8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tomm20Q9DCC8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tomm20Q9DCC8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tomm20Q9DCC8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tomm20Q9DCC8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tomm20Q9DCC8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tomm20Q9DCC8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tomm20Q9DCC8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tomm20Q9DCC8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tomm20Q9DCC8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tomm20Q9DCC8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tomm20Q9DCC8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tomm20Q9DCC8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tomm20Q9DCC8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tomm20Q9DCC8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tomm20Q9DCC8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tomm20Q9DCC8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tomm20Q9DCC8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tomm20Q9DCC8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tomm20Q9DCC8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tomm20Q9DCC8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tomm20Q9DCC8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tomm20Q9DCC8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tomm20Q9DCC8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tomm20Q9DCC8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tomm20Q9DCC8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tomm20Q9DCC8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tomm20Q9DCC8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tomm20Q9DCC8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tomm20Q9DCC8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tomm20Q9DCC8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tomm20Q9DCC8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tomm20Q9DCC8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tomm20Q9DCC8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tomm20Q9DCC8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tomm20Q9DCC8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tomm20Q9DCC8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tomm20Q9DCC8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tomm20Q9DCC8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tomm20Q9DCC8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tomm20Q9DCC8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tomm20Q9DCC8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tomm20Q9DCC8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tomm20Q9DCC8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tomm20Q9DCC8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tomm20Q9DCC8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tomm20Q9DCC8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tomm20Q9DCC8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tomm20Q9DCC8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tomm20Q9DCC8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tomm20Q9DCC8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tomm20Q9DCC8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tomm20Q9DCC8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tomm20Q9DCC8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tomm20Q9DCC8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tomm20Q9DCC8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tomm20Q9DCC8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tomm20Q9DCC8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tomm20Q9DCC8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tomm20Q9DCC8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tomm20Q9DCC8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tomm20Q9DCC8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tomm20Q9DCC8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tomm20Q9DCC8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tomm20Q9DCC8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tomm20Q9DCC8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tomm20Q9DCC8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tomm20Q9DCC8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tomm20Q9DCC8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tomm20Q9DCC8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tomm20Q9DCC8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tomm20Q9DCC8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tomm20Q9DCC8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tomm20Q9DCC8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tomm20Q9DCC8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tomm20Q9DCC8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tomm20Q9DCC8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tomm20Q9DCC8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tomm20Q9DCC8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tomm20Q9DCC8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tomm20Q9DCC8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Tomm20Q9DCC8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tomm20Q9DCC8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms