Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn23Q9D7D7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cldn23Q9D7D7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn23Q9D7D7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn23Q9D7D7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn23Q9D7D7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn23Q9D7D7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cldn23Q9D7D7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn23Q9D7D7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn23Q9D7D7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn23Q9D7D7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cldn23Q9D7D7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn23Q9D7D7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cldn23Q9D7D7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn23Q9D7D7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cldn23Q9D7D7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn23Q9D7D7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn23Q9D7D7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cldn23Q9D7D7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn23Q9D7D7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn23Q9D7D7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cldn23Q9D7D7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cldn23Q9D7D7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cldn23Q9D7D7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn23Q9D7D7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cldn23Q9D7D7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn23Q9D7D7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn23Q9D7D7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cldn23Q9D7D7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn23Q9D7D7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn23Q9D7D7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cldn23Q9D7D7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cldn23Q9D7D7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn23Q9D7D7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn23Q9D7D7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn23Q9D7D7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cldn23Q9D7D7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn23Q9D7D7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn23Q9D7D7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cldn23Q9D7D7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn23Q9D7D7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cldn23Q9D7D7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cldn23Q9D7D7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn23Q9D7D7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn23Q9D7D7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn23Q9D7D7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn23Q9D7D7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cldn23Q9D7D7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn23Q9D7D7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cldn23Q9D7D7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn23Q9D7D7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cldn23Q9D7D7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn23Q9D7D7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cldn23Q9D7D7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn23Q9D7D7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn23Q9D7D7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn23Q9D7D7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cldn23Q9D7D7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn23Q9D7D7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn23Q9D7D7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cldn23Q9D7D7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn23Q9D7D7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn23Q9D7D7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cldn23Q9D7D7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cldn23Q9D7D7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn23Q9D7D7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn23Q9D7D7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn23Q9D7D7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cldn23Q9D7D7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cldn23Q9D7D7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cldn23Q9D7D7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cldn23Q9D7D7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cldn23Q9D7D7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cldn23Q9D7D7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cldn23Q9D7D7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cldn23Q9D7D7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cldn23Q9D7D7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cldn23Q9D7D7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cldn23Q9D7D7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cldn23Q9D7D7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cldn23Q9D7D7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cldn23Q9D7D7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn23Q9D7D7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn23Q9D7D7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn23Q9D7D7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn23Q9D7D7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn23Q9D7D7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn23Q9D7D7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn23Q9D7D7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn23Q9D7D7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn23Q9D7D7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn23Q9D7D7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn23Q9D7D7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn23Q9D7D7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn23Q9D7D7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn23Q9D7D7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn23Q9D7D7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn23Q9D7D7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cldn23Q9D7D7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Cldn23Q9D7D7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.6 ms