Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1T0

Lingo1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo1Q9D1T0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lingo1Q9D1T0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lingo1Q9D1T0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lingo1Q9D1T0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lingo1Q9D1T0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lingo1Q9D1T0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lingo1Q9D1T0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lingo1Q9D1T0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lingo1Q9D1T0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lingo1Q9D1T0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lingo1Q9D1T0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lingo1Q9D1T0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lingo1Q9D1T0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lingo1Q9D1T0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lingo1Q9D1T0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lingo1Q9D1T0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lingo1Q9D1T0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lingo1Q9D1T0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lingo1Q9D1T0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lingo1Q9D1T0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lingo1Q9D1T0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lingo1Q9D1T0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lingo1Q9D1T0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lingo1Q9D1T0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lingo1Q9D1T0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lingo1Q9D1T0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lingo1Q9D1T0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lingo1Q9D1T0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lingo1Q9D1T0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lingo1Q9D1T0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lingo1Q9D1T0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lingo1Q9D1T0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lingo1Q9D1T0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lingo1Q9D1T0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lingo1Q9D1T0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lingo1Q9D1T0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lingo1Q9D1T0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lingo1Q9D1T0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lingo1Q9D1T0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lingo1Q9D1T0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lingo1Q9D1T0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lingo1Q9D1T0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lingo1Q9D1T0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lingo1Q9D1T0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lingo1Q9D1T0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lingo1Q9D1T0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lingo1Q9D1T0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lingo1Q9D1T0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lingo1Q9D1T0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lingo1Q9D1T0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lingo1Q9D1T0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lingo1Q9D1T0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lingo1Q9D1T0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lingo1Q9D1T0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lingo1Q9D1T0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lingo1Q9D1T0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lingo1Q9D1T0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lingo1Q9D1T0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lingo1Q9D1T0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lingo1Q9D1T0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lingo1Q9D1T0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lingo1Q9D1T0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lingo1Q9D1T0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lingo1Q9D1T0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lingo1Q9D1T0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lingo1Q9D1T0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lingo1Q9D1T0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lingo1Q9D1T0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lingo1Q9D1T0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lingo1Q9D1T0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lingo1Q9D1T0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lingo1Q9D1T0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lingo1Q9D1T0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lingo1Q9D1T0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lingo1Q9D1T0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lingo1Q9D1T0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lingo1Q9D1T0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lingo1Q9D1T0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lingo1Q9D1T0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lingo1Q9D1T0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lingo1Q9D1T0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lingo1Q9D1T0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lingo1Q9D1T0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lingo1Q9D1T0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lingo1Q9D1T0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lingo1Q9D1T0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lingo1Q9D1T0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lingo1Q9D1T0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lingo1Q9D1T0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lingo1Q9D1T0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lingo1Q9D1T0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lingo1Q9D1T0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lingo1Q9D1T0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lingo1Q9D1T0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lingo1Q9D1T0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lingo1Q9D1T0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lingo1Q9D1T0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lingo1Q9D1T0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lingo1Q9D1T0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lingo1Q9D1T0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms