Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl28Q9D1B9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl28Q9D1B9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl28Q9D1B9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl28Q9D1B9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl28Q9D1B9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrpl28Q9D1B9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrpl28Q9D1B9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl28Q9D1B9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl28Q9D1B9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl28Q9D1B9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl28Q9D1B9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl28Q9D1B9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl28Q9D1B9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl28Q9D1B9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl28Q9D1B9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl28Q9D1B9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl28Q9D1B9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl28Q9D1B9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl28Q9D1B9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl28Q9D1B9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl28Q9D1B9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl28Q9D1B9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl28Q9D1B9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl28Q9D1B9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl28Q9D1B9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl28Q9D1B9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl28Q9D1B9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl28Q9D1B9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mrpl28Q9D1B9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl28Q9D1B9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl28Q9D1B9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl28Q9D1B9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl28Q9D1B9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl28Q9D1B9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl28Q9D1B9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl28Q9D1B9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl28Q9D1B9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl28Q9D1B9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl28Q9D1B9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl28Q9D1B9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl28Q9D1B9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl28Q9D1B9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl28Q9D1B9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl28Q9D1B9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl28Q9D1B9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl28Q9D1B9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl28Q9D1B9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl28Q9D1B9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl28Q9D1B9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl28Q9D1B9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl28Q9D1B9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl28Q9D1B9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl28Q9D1B9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl28Q9D1B9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl28Q9D1B9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl28Q9D1B9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl28Q9D1B9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl28Q9D1B9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl28Q9D1B9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl28Q9D1B9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl28Q9D1B9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl28Q9D1B9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mrpl28Q9D1B9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl28Q9D1B9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl28Q9D1B9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl28Q9D1B9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl28Q9D1B9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl28Q9D1B9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl28Q9D1B9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl28Q9D1B9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl28Q9D1B9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mrpl28Q9D1B9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl28Q9D1B9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mrpl28Q9D1B9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl28Q9D1B9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mrpl28Q9D1B9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrpl28Q9D1B9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrpl28Q9D1B9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mrpl28Q9D1B9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl28Q9D1B9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mrpl28Q9D1B9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Mrpl28Q9D1B9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mrpl28Q9D1B9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mrpl28Q9D1B9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mrpl28Q9D1B9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mrpl28Q9D1B9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mrpl28Q9D1B9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mrpl28Q9D1B9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Mrpl28Q9D1B9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mrpl28Q9D1B9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mrpl28Q9D1B9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mrpl28Q9D1B9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mrpl28Q9D1B9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mrpl28Q9D1B9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mrpl28Q9D1B9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mrpl28Q9D1B9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mrpl28Q9D1B9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms