Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR35

Ctrb1, Chymotrypsinogen B, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctrb1Q9CR35 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctrb1Q9CR35 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctrb1Q9CR35 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctrb1Q9CR35 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctrb1Q9CR35 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ctrb1Q9CR35 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctrb1Q9CR35 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctrb1Q9CR35 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctrb1Q9CR35 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctrb1Q9CR35 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctrb1Q9CR35 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctrb1Q9CR35 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctrb1Q9CR35 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctrb1Q9CR35 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctrb1Q9CR35 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctrb1Q9CR35 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctrb1Q9CR35 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctrb1Q9CR35 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctrb1Q9CR35 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctrb1Q9CR35 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctrb1Q9CR35 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctrb1Q9CR35 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctrb1Q9CR35 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctrb1Q9CR35 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctrb1Q9CR35 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctrb1Q9CR35 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctrb1Q9CR35 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctrb1Q9CR35 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctrb1Q9CR35 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctrb1Q9CR35 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctrb1Q9CR35 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctrb1Q9CR35 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctrb1Q9CR35 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctrb1Q9CR35 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ctrb1Q9CR35 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctrb1Q9CR35 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctrb1Q9CR35 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctrb1Q9CR35 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctrb1Q9CR35 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctrb1Q9CR35 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctrb1Q9CR35 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctrb1Q9CR35 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctrb1Q9CR35 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctrb1Q9CR35 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctrb1Q9CR35 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctrb1Q9CR35 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctrb1Q9CR35 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctrb1Q9CR35 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctrb1Q9CR35 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctrb1Q9CR35 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctrb1Q9CR35 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctrb1Q9CR35 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctrb1Q9CR35 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctrb1Q9CR35 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctrb1Q9CR35 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctrb1Q9CR35 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctrb1Q9CR35 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctrb1Q9CR35 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctrb1Q9CR35 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctrb1Q9CR35 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctrb1Q9CR35 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctrb1Q9CR35 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctrb1Q9CR35 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctrb1Q9CR35 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctrb1Q9CR35 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctrb1Q9CR35 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctrb1Q9CR35 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctrb1Q9CR35 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctrb1Q9CR35 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctrb1Q9CR35 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctrb1Q9CR35 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctrb1Q9CR35 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctrb1Q9CR35 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctrb1Q9CR35 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctrb1Q9CR35 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctrb1Q9CR35 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctrb1Q9CR35 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.5 ms