Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI3

Gmfb, Glia maturation factor beta, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GmfbQ9CQI3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GmfbQ9CQI3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GmfbQ9CQI3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GmfbQ9CQI3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GmfbQ9CQI3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GmfbQ9CQI3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GmfbQ9CQI3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GmfbQ9CQI3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GmfbQ9CQI3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GmfbQ9CQI3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GmfbQ9CQI3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GmfbQ9CQI3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GmfbQ9CQI3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GmfbQ9CQI3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GmfbQ9CQI3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GmfbQ9CQI3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GmfbQ9CQI3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GmfbQ9CQI3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GmfbQ9CQI3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GmfbQ9CQI3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GmfbQ9CQI3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GmfbQ9CQI3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GmfbQ9CQI3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GmfbQ9CQI3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GmfbQ9CQI3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GmfbQ9CQI3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GmfbQ9CQI3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GmfbQ9CQI3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GmfbQ9CQI3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GmfbQ9CQI3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GmfbQ9CQI3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GmfbQ9CQI3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GmfbQ9CQI3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GmfbQ9CQI3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GmfbQ9CQI3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GmfbQ9CQI3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GmfbQ9CQI3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GmfbQ9CQI3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GmfbQ9CQI3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GmfbQ9CQI3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GmfbQ9CQI3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GmfbQ9CQI3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GmfbQ9CQI3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GmfbQ9CQI3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GmfbQ9CQI3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GmfbQ9CQI3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GmfbQ9CQI3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GmfbQ9CQI3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GmfbQ9CQI3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GmfbQ9CQI3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GmfbQ9CQI3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GmfbQ9CQI3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GmfbQ9CQI3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GmfbQ9CQI3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GmfbQ9CQI3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GmfbQ9CQI3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GmfbQ9CQI3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GmfbQ9CQI3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GmfbQ9CQI3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GmfbQ9CQI3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GmfbQ9CQI3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GmfbQ9CQI3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GmfbQ9CQI3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GmfbQ9CQI3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GmfbQ9CQI3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GmfbQ9CQI3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GmfbQ9CQI3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GmfbQ9CQI3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GmfbQ9CQI3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GmfbQ9CQI3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GmfbQ9CQI3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GmfbQ9CQI3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GmfbQ9CQI3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GmfbQ9CQI3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GmfbQ9CQI3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GmfbQ9CQI3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GmfbQ9CQI3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GmfbQ9CQI3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GmfbQ9CQI3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GmfbQ9CQI3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GmfbQ9CQI3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GmfbQ9CQI3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GmfbQ9CQI3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GmfbQ9CQI3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GmfbQ9CQI3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GmfbQ9CQI3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GmfbQ9CQI3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GmfbQ9CQI3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GmfbQ9CQI3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GmfbQ9CQI3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GmfbQ9CQI3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GmfbQ9CQI3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GmfbQ9CQI3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GmfbQ9CQI3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GmfbQ9CQI3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GmfbQ9CQI3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GmfbQ9CQI3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GmfbQ9CQI3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GmfbQ9CQI3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GmfbQ9CQI3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms