Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab11fip5Q8R361 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab11fip5Q8R361 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab11fip5Q8R361 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab11fip5Q8R361 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab11fip5Q8R361 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip5Q8R361 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip5Q8R361 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11fip5Q8R361 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab11fip5Q8R361 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11fip5Q8R361 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab11fip5Q8R361 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab11fip5Q8R361 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip5Q8R361 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11fip5Q8R361 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11fip5Q8R361 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11fip5Q8R361 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab11fip5Q8R361 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11fip5Q8R361 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11fip5Q8R361 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab11fip5Q8R361 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab11fip5Q8R361 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab11fip5Q8R361 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab11fip5Q8R361 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab11fip5Q8R361 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab11fip5Q8R361 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab11fip5Q8R361 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab11fip5Q8R361 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab11fip5Q8R361 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab11fip5Q8R361 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab11fip5Q8R361 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab11fip5Q8R361 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab11fip5Q8R361 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab11fip5Q8R361 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab11fip5Q8R361 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab11fip5Q8R361 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab11fip5Q8R361 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab11fip5Q8R361 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab11fip5Q8R361 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab11fip5Q8R361 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab11fip5Q8R361 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab11fip5Q8R361 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab11fip5Q8R361 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab11fip5Q8R361 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab11fip5Q8R361 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab11fip5Q8R361 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab11fip5Q8R361 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab11fip5Q8R361 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab11fip5Q8R361 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab11fip5Q8R361 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab11fip5Q8R361 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab11fip5Q8R361 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab11fip5Q8R361 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rab11fip5Q8R361 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab11fip5Q8R361 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab11fip5Q8R361 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab11fip5Q8R361 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab11fip5Q8R361 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab11fip5Q8R361 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab11fip5Q8R361 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab11fip5Q8R361 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab11fip5Q8R361 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab11fip5Q8R361 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab11fip5Q8R361 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab11fip5Q8R361 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab11fip5Q8R361 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab11fip5Q8R361 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab11fip5Q8R361 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rab11fip5Q8R361 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab11fip5Q8R361 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab11fip5Q8R361 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab11fip5Q8R361 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab11fip5Q8R361 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab11fip5Q8R361 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab11fip5Q8R361 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rab11fip5Q8R361 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab11fip5Q8R361 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab11fip5Q8R361 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab11fip5Q8R361 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab11fip5Q8R361 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab11fip5Q8R361 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab11fip5Q8R361 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab11fip5Q8R361 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Rab11fip5Q8R361 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab11fip5Q8R361 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab11fip5Q8R361 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab11fip5Q8R361 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab11fip5Q8R361 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab11fip5Q8R361 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab11fip5Q8R361 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab11fip5Q8R361 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab11fip5Q8R361 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab11fip5Q8R361 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab11fip5Q8R361 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab11fip5Q8R361 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab11fip5Q8R361 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab11fip5Q8R361 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab11fip5Q8R361 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab11fip5Q8R361 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab11fip5Q8R361 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms