Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cops7bQ8BV13 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cops7bQ8BV13 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cops7bQ8BV13 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cops7bQ8BV13 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cops7bQ8BV13 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cops7bQ8BV13 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cops7bQ8BV13 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cops7bQ8BV13 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cops7bQ8BV13 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cops7bQ8BV13 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cops7bQ8BV13 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cops7bQ8BV13 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cops7bQ8BV13 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cops7bQ8BV13 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cops7bQ8BV13 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cops7bQ8BV13 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cops7bQ8BV13 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cops7bQ8BV13 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cops7bQ8BV13 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cops7bQ8BV13 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cops7bQ8BV13 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cops7bQ8BV13 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cops7bQ8BV13 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cops7bQ8BV13 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cops7bQ8BV13 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cops7bQ8BV13 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cops7bQ8BV13 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cops7bQ8BV13 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cops7bQ8BV13 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cops7bQ8BV13 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cops7bQ8BV13 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cops7bQ8BV13 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cops7bQ8BV13 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cops7bQ8BV13 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cops7bQ8BV13 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cops7bQ8BV13 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cops7bQ8BV13 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cops7bQ8BV13 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cops7bQ8BV13 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cops7bQ8BV13 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cops7bQ8BV13 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cops7bQ8BV13 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cops7bQ8BV13 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cops7bQ8BV13 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cops7bQ8BV13 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cops7bQ8BV13 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cops7bQ8BV13 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cops7bQ8BV13 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cops7bQ8BV13 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cops7bQ8BV13 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cops7bQ8BV13 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cops7bQ8BV13 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cops7bQ8BV13 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cops7bQ8BV13 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cops7bQ8BV13 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cops7bQ8BV13 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cops7bQ8BV13 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cops7bQ8BV13 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cops7bQ8BV13 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cops7bQ8BV13 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cops7bQ8BV13 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cops7bQ8BV13 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cops7bQ8BV13 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cops7bQ8BV13 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cops7bQ8BV13 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cops7bQ8BV13 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cops7bQ8BV13 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cops7bQ8BV13 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cops7bQ8BV13 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cops7bQ8BV13 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cops7bQ8BV13 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cops7bQ8BV13 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cops7bQ8BV13 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cops7bQ8BV13 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cops7bQ8BV13 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cops7bQ8BV13 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cops7bQ8BV13 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cops7bQ8BV13 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cops7bQ8BV13 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cops7bQ8BV13 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cops7bQ8BV13 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cops7bQ8BV13 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cops7bQ8BV13 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cops7bQ8BV13 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cops7bQ8BV13 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cops7bQ8BV13 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cops7bQ8BV13 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cops7bQ8BV13 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cops7bQ8BV13 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cops7bQ8BV13 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cops7bQ8BV13 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cops7bQ8BV13 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cops7bQ8BV13 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cops7bQ8BV13 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cops7bQ8BV13 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cops7bQ8BV13 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cops7bQ8BV13 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cops7bQ8BV13 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cops7bQ8BV13 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms