Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrrc27Q80YS5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrrc27Q80YS5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrrc27Q80YS5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrrc27Q80YS5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrrc27Q80YS5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrrc27Q80YS5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrc27Q80YS5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrc27Q80YS5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrc27Q80YS5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrrc27Q80YS5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrrc27Q80YS5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrc27Q80YS5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrc27Q80YS5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrc27Q80YS5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrc27Q80YS5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrc27Q80YS5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrrc27Q80YS5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrrc27Q80YS5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrc27Q80YS5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrc27Q80YS5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Lrrc27Q80YS5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrc27Q80YS5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrc27Q80YS5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrc27Q80YS5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrc27Q80YS5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrrc27Q80YS5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrc27Q80YS5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrc27Q80YS5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrc27Q80YS5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc27Q80YS5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc27Q80YS5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrc27Q80YS5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrc27Q80YS5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrc27Q80YS5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrc27Q80YS5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrc27Q80YS5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrc27Q80YS5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc27Q80YS5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc27Q80YS5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc27Q80YS5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc27Q80YS5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc27Q80YS5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc27Q80YS5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc27Q80YS5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc27Q80YS5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrrc27Q80YS5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrc27Q80YS5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrc27Q80YS5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrrc27Q80YS5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrc27Q80YS5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrc27Q80YS5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrc27Q80YS5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrc27Q80YS5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrc27Q80YS5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrc27Q80YS5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrc27Q80YS5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc27Q80YS5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc27Q80YS5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc27Q80YS5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc27Q80YS5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc27Q80YS5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc27Q80YS5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc27Q80YS5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrc27Q80YS5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc27Q80YS5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc27Q80YS5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrc27Q80YS5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrc27Q80YS5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc27Q80YS5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc27Q80YS5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc27Q80YS5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc27Q80YS5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc27Q80YS5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrc27Q80YS5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrc27Q80YS5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrrc27Q80YS5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc27Q80YS5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc27Q80YS5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc27Q80YS5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc27Q80YS5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc27Q80YS5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc27Q80YS5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc27Q80YS5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc27Q80YS5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc27Q80YS5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc27Q80YS5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc27Q80YS5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc27Q80YS5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc27Q80YS5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc27Q80YS5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc27Q80YS5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc27Q80YS5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc27Q80YS5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc27Q80YS5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc27Q80YS5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc27Q80YS5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc27Q80YS5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc27Q80YS5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc27Q80YS5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
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