Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrrc27Q80YS5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrrc27Q80YS5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Lrrc27Q80YS5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrrc27Q80YS5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrrc27Q80YS5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lrrc27Q80YS5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lrrc27Q80YS5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrc27Q80YS5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Lrrc27Q80YS5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrrc27Q80YS5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lrrc27Q80YS5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrc27Q80YS5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrc27Q80YS5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrc27Q80YS5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrc27Q80YS5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lrrc27Q80YS5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrrc27Q80YS5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Lrrc27Q80YS5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrc27Q80YS5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lrrc27Q80YS5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Lrrc27Q80YS5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrc27Q80YS5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrc27Q80YS5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrc27Q80YS5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrc27Q80YS5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrrc27Q80YS5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrc27Q80YS5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrc27Q80YS5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrc27Q80YS5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc27Q80YS5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc27Q80YS5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lrrc27Q80YS5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrc27Q80YS5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrc27Q80YS5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrc27Q80YS5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrc27Q80YS5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrc27Q80YS5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lrrc27Q80YS5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc27Q80YS5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc27Q80YS5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc27Q80YS5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lrrc27Q80YS5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc27Q80YS5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc27Q80YS5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc27Q80YS5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrrc27Q80YS5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrc27Q80YS5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrc27Q80YS5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrrc27Q80YS5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrc27Q80YS5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrc27Q80YS5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrc27Q80YS5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrc27Q80YS5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrc27Q80YS5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrc27Q80YS5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrc27Q80YS5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc27Q80YS5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc27Q80YS5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc27Q80YS5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc27Q80YS5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc27Q80YS5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc27Q80YS5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc27Q80YS5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrc27Q80YS5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc27Q80YS5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc27Q80YS5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrc27Q80YS5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrc27Q80YS5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc27Q80YS5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc27Q80YS5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc27Q80YS5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc27Q80YS5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc27Q80YS5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrc27Q80YS5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrc27Q80YS5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrrc27Q80YS5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc27Q80YS5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc27Q80YS5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc27Q80YS5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc27Q80YS5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc27Q80YS5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc27Q80YS5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc27Q80YS5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc27Q80YS5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc27Q80YS5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc27Q80YS5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc27Q80YS5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc27Q80YS5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc27Q80YS5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc27Q80YS5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc27Q80YS5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc27Q80YS5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc27Q80YS5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc27Q80YS5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc27Q80YS5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc27Q80YS5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc27Q80YS5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc27Q80YS5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc27Q80YS5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms