Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9K9

Nrxn3, Neurexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrxn3Q6P9K9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC36,61■■■■□ 3,45
Nrxn3Q6P9K9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,61■■■■□ 3,45
Nrxn3Q6P9K9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,61■■■■□ 3,45
Nrxn3Q6P9K9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC36,6■■■■□ 3,45
Nrxn3Q6P9K9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,58■■■■□ 3,45
Nrxn3Q6P9K9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,57■■■■□ 3,44
Nrxn3Q6P9K9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,56■■■■□ 3,44
Nrxn3Q6P9K9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,55■■■■□ 3,44
Nrxn3Q6P9K9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC36,52■■■■□ 3,44
Nrxn3Q6P9K9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,51■■■■□ 3,43
Nrxn3Q6P9K9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36,48■■■■□ 3,43
Nrxn3Q6P9K9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,47■■■■□ 3,43
Nrxn3Q6P9K9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36,47■■■■□ 3,43
Nrxn3Q6P9K9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,41■■■■□ 3,42
Nrxn3Q6P9K9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,4■■■■□ 3,42
Nrxn3Q6P9K9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC36,39■■■■□ 3,42
Nrxn3Q6P9K9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,38■■■■□ 3,42
Nrxn3Q6P9K9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36,37■■■■□ 3,41
Nrxn3Q6P9K9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC36,36■■■■□ 3,41
Nrxn3Q6P9K9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,35■■■■□ 3,41
Nrxn3Q6P9K9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,35■■■■□ 3,41
Nrxn3Q6P9K9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC36,34■■■■□ 3,41
Nrxn3Q6P9K9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,33■■■■□ 3,41
Nrxn3Q6P9K9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,32■■■■□ 3,4
Nrxn3Q6P9K9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC36,29■■■■□ 3,4
Nrxn3Q6P9K9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC36,28■■■■□ 3,4
Nrxn3Q6P9K9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36,28■■■■□ 3,4
Nrxn3Q6P9K9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36,27■■■■□ 3,4
Nrxn3Q6P9K9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Nrxn3Q6P9K9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC36,24■■■■□ 3,39
Nrxn3Q6P9K9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36,2■■■■□ 3,38
Nrxn3Q6P9K9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36,18■■■■□ 3,38
Nrxn3Q6P9K9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC36,17■■■■□ 3,38
Nrxn3Q6P9K9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC36,15■■■■□ 3,38
Nrxn3Q6P9K9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC36,15■■■■□ 3,38
Nrxn3Q6P9K9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC36,15■■■■□ 3,38
Nrxn3Q6P9K9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,13■■■■□ 3,37
Nrxn3Q6P9K9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Nrxn3Q6P9K9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC36,1■■■■□ 3,37
Nrxn3Q6P9K9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC36,1■■■■□ 3,37
Nrxn3Q6P9K9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,09■■■■□ 3,37
Nrxn3Q6P9K9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC36,09■■■■□ 3,37
Nrxn3Q6P9K9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,08■■■■□ 3,37
Nrxn3Q6P9K9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,08■■■■□ 3,37
Nrxn3Q6P9K9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC36,07■■■■□ 3,37
Nrxn3Q6P9K9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC36,06■■■■□ 3,36
Nrxn3Q6P9K9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36,05■■■■□ 3,36
Nrxn3Q6P9K9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC36,05■■■■□ 3,36
Nrxn3Q6P9K9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC36,05■■■■□ 3,36
Nrxn3Q6P9K9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,04■■■■□ 3,36
Nrxn3Q6P9K9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,04■■■■□ 3,36
Nrxn3Q6P9K9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC36,02■■■■□ 3,36
Nrxn3Q6P9K9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,01■■■■□ 3,36
Nrxn3Q6P9K9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC36,01■■■■□ 3,35
Nrxn3Q6P9K9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3,35
Nrxn3Q6P9K9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC36■■■■□ 3,35
Nrxn3Q6P9K9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3,35
Nrxn3Q6P9K9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Nrxn3Q6P9K9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35,97■■■■□ 3,35
Nrxn3Q6P9K9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC35,96■■■■□ 3,35
Nrxn3Q6P9K9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,96■■■■□ 3,35
Nrxn3Q6P9K9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,95■■■■□ 3,35
Nrxn3Q6P9K9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,95■■■■□ 3,35
Nrxn3Q6P9K9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC35,95■■■■□ 3,35
Nrxn3Q6P9K9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35,95■■■■□ 3,34
Nrxn3Q6P9K9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,93■■■■□ 3,34
Nrxn3Q6P9K9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Nrxn3Q6P9K9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35,92■■■■□ 3,34
Nrxn3Q6P9K9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Nrxn3Q6P9K9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC35,91■■■■□ 3,34
Nrxn3Q6P9K9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,91■■■■□ 3,34
Nrxn3Q6P9K9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,89■■■■□ 3,34
Nrxn3Q6P9K9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC35,88■■■■□ 3,33
Nrxn3Q6P9K9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC35,88■■■■□ 3,33
Nrxn3Q6P9K9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
Nrxn3Q6P9K9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
Nrxn3Q6P9K9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC35,86■■■■□ 3,33
Nrxn3Q6P9K9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
Nrxn3Q6P9K9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
Nrxn3Q6P9K9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC35,85■■■■□ 3,33
Nrxn3Q6P9K9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC35,84■■■■□ 3,33
Nrxn3Q6P9K9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC35,84■■■■□ 3,33
Nrxn3Q6P9K9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC35,82■■■■□ 3,32
Nrxn3Q6P9K9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,79■■■■□ 3,32
Nrxn3Q6P9K9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,79■■■■□ 3,32
Nrxn3Q6P9K9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC35,79■■■■□ 3,32
Nrxn3Q6P9K9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC35,78■■■■□ 3,32
Nrxn3Q6P9K9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,78■■■■□ 3,32
Nrxn3Q6P9K9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,78■■■■□ 3,32
Nrxn3Q6P9K9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,78■■■■□ 3,32
Nrxn3Q6P9K9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,31
Nrxn3Q6P9K9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,74■■■■□ 3,31
Nrxn3Q6P9K9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,73■■■■□ 3,31
Nrxn3Q6P9K9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,72■■■■□ 3,31
Nrxn3Q6P9K9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC35,69■■■■□ 3,3
Nrxn3Q6P9K9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,69■■■■□ 3,3
Nrxn3Q6P9K9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
Nrxn3Q6P9K9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,66■■■■□ 3,3
Nrxn3Q6P9K9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC35,66■■■■□ 3,3
Nrxn3Q6P9K9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC35,66■■■■□ 3,3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25,5 ms