Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9K9

Nrxn3, Neurexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrxn3Q6P9K9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Nrxn3Q6P9K9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Nrxn3Q6P9K9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Nrxn3Q6P9K9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Nrxn3Q6P9K9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Nrxn3Q6P9K9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Nrxn3Q6P9K9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Nrxn3Q6P9K9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Nrxn3Q6P9K9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
Nrxn3Q6P9K9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Nrxn3Q6P9K9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Nrxn3Q6P9K9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Nrxn3Q6P9K9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Nrxn3Q6P9K9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Nrxn3Q6P9K9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Nrxn3Q6P9K9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Nrxn3Q6P9K9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
Nrxn3Q6P9K9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Nrxn3Q6P9K9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
Nrxn3Q6P9K9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Nrxn3Q6P9K9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Nrxn3Q6P9K9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
Nrxn3Q6P9K9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Nrxn3Q6P9K9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Nrxn3Q6P9K9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Nrxn3Q6P9K9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Nrxn3Q6P9K9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Nrxn3Q6P9K9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Nrxn3Q6P9K9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Nrxn3Q6P9K9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Nrxn3Q6P9K9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
Nrxn3Q6P9K9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Nrxn3Q6P9K9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Nrxn3Q6P9K9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Nrxn3Q6P9K9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Nrxn3Q6P9K9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Nrxn3Q6P9K9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Nrxn3Q6P9K9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Nrxn3Q6P9K9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Nrxn3Q6P9K9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Nrxn3Q6P9K9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Nrxn3Q6P9K9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Nrxn3Q6P9K9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Nrxn3Q6P9K9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Nrxn3Q6P9K9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
Nrxn3Q6P9K9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
Nrxn3Q6P9K9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Nrxn3Q6P9K9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Nrxn3Q6P9K9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Nrxn3Q6P9K9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Nrxn3Q6P9K9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Nrxn3Q6P9K9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Nrxn3Q6P9K9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Nrxn3Q6P9K9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.35
Nrxn3Q6P9K9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Nrxn3Q6P9K9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Nrxn3Q6P9K9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Nrxn3Q6P9K9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Nrxn3Q6P9K9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Nrxn3Q6P9K9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Nrxn3Q6P9K9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Nrxn3Q6P9K9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Nrxn3Q6P9K9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Nrxn3Q6P9K9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
Nrxn3Q6P9K9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
Nrxn3Q6P9K9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Nrxn3Q6P9K9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Nrxn3Q6P9K9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Nrxn3Q6P9K9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Nrxn3Q6P9K9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Nrxn3Q6P9K9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Nrxn3Q6P9K9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Nrxn3Q6P9K9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Nrxn3Q6P9K9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Nrxn3Q6P9K9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Nrxn3Q6P9K9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Nrxn3Q6P9K9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Nrxn3Q6P9K9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Nrxn3Q6P9K9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Nrxn3Q6P9K9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Nrxn3Q6P9K9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Nrxn3Q6P9K9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Nrxn3Q6P9K9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Nrxn3Q6P9K9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Nrxn3Q6P9K9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Nrxn3Q6P9K9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Nrxn3Q6P9K9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Nrxn3Q6P9K9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Nrxn3Q6P9K9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Nrxn3Q6P9K9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Nrxn3Q6P9K9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Nrxn3Q6P9K9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Nrxn3Q6P9K9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Nrxn3Q6P9K9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Nrxn3Q6P9K9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Nrxn3Q6P9K9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Nrxn3Q6P9K9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Nrxn3Q6P9K9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Nrxn3Q6P9K9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Nrxn3Q6P9K9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms