Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH68

Xkrx, XK-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XkrxQ5GH68 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XkrxQ5GH68 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XkrxQ5GH68 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XkrxQ5GH68 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
XkrxQ5GH68 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XkrxQ5GH68 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XkrxQ5GH68 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XkrxQ5GH68 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XkrxQ5GH68 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
XkrxQ5GH68 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XkrxQ5GH68 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
XkrxQ5GH68 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XkrxQ5GH68 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XkrxQ5GH68 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XkrxQ5GH68 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XkrxQ5GH68 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XkrxQ5GH68 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XkrxQ5GH68 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XkrxQ5GH68 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XkrxQ5GH68 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XkrxQ5GH68 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
XkrxQ5GH68 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XkrxQ5GH68 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XkrxQ5GH68 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XkrxQ5GH68 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XkrxQ5GH68 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XkrxQ5GH68 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XkrxQ5GH68 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XkrxQ5GH68 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
XkrxQ5GH68 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
XkrxQ5GH68 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XkrxQ5GH68 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XkrxQ5GH68 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XkrxQ5GH68 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XkrxQ5GH68 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XkrxQ5GH68 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XkrxQ5GH68 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XkrxQ5GH68 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
XkrxQ5GH68 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XkrxQ5GH68 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XkrxQ5GH68 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XkrxQ5GH68 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XkrxQ5GH68 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XkrxQ5GH68 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
XkrxQ5GH68 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XkrxQ5GH68 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XkrxQ5GH68 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
XkrxQ5GH68 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XkrxQ5GH68 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
XkrxQ5GH68 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XkrxQ5GH68 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XkrxQ5GH68 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
XkrxQ5GH68 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XkrxQ5GH68 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XkrxQ5GH68 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XkrxQ5GH68 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XkrxQ5GH68 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XkrxQ5GH68 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XkrxQ5GH68 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XkrxQ5GH68 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XkrxQ5GH68 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XkrxQ5GH68 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XkrxQ5GH68 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XkrxQ5GH68 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XkrxQ5GH68 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XkrxQ5GH68 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XkrxQ5GH68 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XkrxQ5GH68 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XkrxQ5GH68 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XkrxQ5GH68 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XkrxQ5GH68 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XkrxQ5GH68 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
XkrxQ5GH68 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
XkrxQ5GH68 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
XkrxQ5GH68 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
XkrxQ5GH68 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XkrxQ5GH68 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
XkrxQ5GH68 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
XkrxQ5GH68 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
XkrxQ5GH68 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
XkrxQ5GH68 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
XkrxQ5GH68 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XkrxQ5GH68 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XkrxQ5GH68 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
XkrxQ5GH68 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
XkrxQ5GH68 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
XkrxQ5GH68 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XkrxQ5GH68 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
XkrxQ5GH68 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XkrxQ5GH68 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XkrxQ5GH68 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
XkrxQ5GH68 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
XkrxQ5GH68 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XkrxQ5GH68 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
XkrxQ5GH68 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
XkrxQ5GH68 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
XkrxQ5GH68 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
XkrxQ5GH68 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
XkrxQ5GH68 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
XkrxQ5GH68 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms